Sezonul 2 din Stargate Atlantis a avut premiera pe 15 iulie 2005.
2 - 1Asediul (3) Jul. 15, 2005
2 - 2Intrusul Jul. 22, 2005
2 - 3Fugarul Jul. 29, 2005
2 - 4Duetul Aug. 05, 2005
2 - 5Condamnați Aug. 12, 2005
2 - 6Treimea Aug. 19, 2005
2 - 7Instinctul Aug. 26, 2005
2 - 8Transformarea Sep. 09, 2005
2 - 9Aurora Sep. 23, 2005
2 - 10Băieții pierduți Sep. 23, 2005
2 - 11Nava-Stup Nov. 16, 2005
2 - 12Revelația Nov. 28, 2005
2 - 13Punctul critic Dec. 05, 2005
2 - 14Echilibru sub presiune Dec. 10, 2005
2 - 15Turnul Dec. 19, 2005
2 - 16Lunga despărțire Jan. 02, 2006
2 - 17Lovitura de stat Jan. 09, 2006
2 - 18Michael Jan. 16, 2006
2 - 19Infernul Jan. 23, 2006
2 - 20Aliați (1) Jan. 30, 2006